O Media Smart funciona com os seguintes órgãos:
Comité de Direção
O Comité de Direção é formado pelos representantes de todas as empresas e entidades patrocinadoras do programa. É responsável por aprovar a Estratégia do Media Smart e o Plano de Atividades Anual. Reúne pelo menos quatro vezes ao ano.
Serviço de Secretariado
O Serviço de Secretariado garante a implementação do programa, relaciona-se com os patrocinadores agindo como um ponto de contacto permanente com futuros patrocinadores, com a imprensa e com os líderes de opinião. Garante o pleno funcionamento do programa, mantendo o site atualizado, dando resposta a questões colocadas pelas escolas, professores, pais e alunos. Promove e acompanha a criação de novos materiais e mantém-se em permanente contato com os Media Smart de toda a Europa.